แพทย์ในเยอรมันทดลองใช้ยาปฏิชีวนะรักษาเชื้อ 
การหาแหล่งที่มาของเชื้อแบคทีเรียอีโคไลยังคงดำมืด แพทย์ในเยอรมนีได้คิดค้นวิธีการใหม่ ๆ ในการรักษาผู้ติดเชื้อ โดยทดลองใช้ยาปฏิชีวนะ ซึ่งสร้างความวิตกว่าอาจจะก่อให้เกิดผลร้ายมากกว่าผลดี
คณะแพทย์ในเยอรมนีพยายามใช้ลองใช้วิธีใหม่ในการรักษาผู้ป่วยที่ติดเชื้อแบคทีเรียอีโคไลสายพันธุ์ที่กำลังระบาดอยู่ในขณะนี้ โดยใช้การเปลี่ยนถ่ายเกล็ดเลือด รวมถึงให้ยาปฏิชีวนะ ซึ่งเบื้องต้นประสบความสำเร็จ แต่ยังคงมีความกังวลว่า อาจจะเกิดผลข้างเคียงถึงขั้นเสียชีวิต โดยวิธีการรักษาโดยทั่วไปคือการให้ผู้ติดเชื้อดื่มน้ำมาก ๆ และการให้เลือด แต่กรณีที่ผู้ป่วยมีอาการฮีโมลีติก ยูเรมิค ซินโดรม หรือ เอชยูเอส ที่อาจทำให้ไตวายได้ แพทย์อาจต้องใช้วิธีการรักษาที่ซับซ้อนขึ้น
ทั้งนี้องค์การอนามัยโลกและศูนย์ควบคุมโรคติดต่อของสหรัฐหรือซีดีซีไม่แนะนำให้ใช้ยาปฏิชีวนะในการรักษาผู้ติดเชื้ออีโคไล เพราะอาจจะทำให้เชื้อปล่อยสารพิษออกมามากขึ้น และ อาจจะกลายพันธุ์เป็นสายพันธุ์ที่รุนแรงและดื้อยามากขึ้นอีก ทำให้ควบคุมยาก ยกเว้นในบางกรณีเท่านั้น ขณะนี้โรงพยาบาลในเยอรมนีบางแห่งเริ่มใช้วิธีการรักษาแบบใหม่กับผู้ติดเชื้อแล้ว
ขณะที่เกษตรกรที่ได้รับผลกระทบจากการระบาดของเชื้ออีโคไล สหภาพยุโรปจะพิจารณาว่า เกษตรเหล่านี้ควรจะได้รับค่าชดเชยร้อยละ 30 ของมูลค่าผักที่ขายไม่ได้ หรือไม่ โดยคาดว่าจะมีการตกลงเรื่องหลักการกันในวันนี้